Detección y Cuantificación por QPCR de Colletotrichum Lindemuthianum en Trjidos y Semillas de Frijol en Antioquia, Colombia

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La antracnosis del frijol causada por Colletotrichum lindemuthianum, es una de las enfermedades más limitantes de este cultivo. El patógeno se dispersa principalmente por semilla, por lo que la siembra de material certificado es fundamental para su manejo. La detección de C. lindemuthianum se basa en el uso de medios de cultivo y en los últimos años en técnicas de PCR; siendo la PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR) una alternativa que ofrece altos niveles de especificidad, sensibilidad y rapidez. En este trabajo se evaluó dicha técnica utilizando los cebadores ClF432/ClR533 y el compuesto orgánico SYBR Green. Para esto se probó la especificidad de los cebadores a partir de ADN de micelio del hongo y de tejidos infectados de frijol (foliar y vainas), construyéndose una curva estándar basada en diluciones seriadas de ADN. Finalmente, se evaluó la presencia de C. lindemuthianum en muestras de semillas de frijol variedad Cargamanto comerciales y obtenidas directamente del campo. Las pruebas de qPCR detectaron C. lindemuthianum en las ocho muestras de micelio [Ciclo Umbral (Ct): 4,3-9,85] y en 17 de las 18 muestras de tejidos de frijol, independientemente de que éstas fueran o no sintomáticas (Ct: 16,71-29,38). El patógeno fue detectado en el 84 % del total de semillas evaluadas y en 85 % de las muestras comerciales, aunque la concentración de ADN del patógeno en estas últimas fue inferior que para las semillas no-comerciales (1-32,2 pg·μL-1 vs 1-279,3 pg·μL-1). Estos resultados enfatizan la necesidad de fortalecer los programas de certificación de semilla de frijol en Colombia.

Authors: 
Katherin Vanegas-Berrouet
Authors: 
Leonardo Martínez-Pacheco
Authors: 
Mauricio Salazar-Yepes
Authors: 
Pablo Gutiérrez-Sánchez
Authors: 
Mauricio Marín-Montoya
Publisher: 
Bioagro
Year: 
2014